Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms