Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM15Q7Z3B0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms