Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NSMFQ6X4W1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMFQ6X4W1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms