Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCERG1LQ5VWI1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCERG1LQ5VWI1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms