Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC30Q5VVM6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC30Q5VVM6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms