Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRNL1Q5VV63 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRNL1Q5VV63 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms