Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC181Q5TID7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC181Q5TID7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms