Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAD1Q5T700 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAD1Q5T700 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms