Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRMS1LQ5PSV4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms