Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COLEC12Q5KU26 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms