Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47A1Q5JQC4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47A1Q5JQC4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms