Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSD17B12Q53GQ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms