Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP55Q53EZ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP55Q53EZ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms