Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3BQ502W6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms