Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms