Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2B3Q16720 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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