Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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