Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A3Q16572 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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