Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK3Q16288 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK3Q16288 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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