Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZFHX3Q15911 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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