Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAM1Q15629 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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