Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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SEC23BQ15437 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SEC23BQ15437 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC23BQ15437 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SEC23BQ15437 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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SEC23BQ15437 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEC23BQ15437 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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