Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.118e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 TMC6-219ENST00000591594 614 ntTSL 318.64■□□□□ 0.571e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 EPN1-206ENST00000589704 250 ntTSL 57.56□□□□□ -1.29e-7■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 SLC38A3-206ENST00000614032 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-9■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 219.7■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)17.31■□□□□ 0.363e-9■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 514.62□□□□□ -0.074e-8■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.444e-8■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-11■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.886e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 RABAC1-204ENST00000598057 662 nt20.13■□□□□ 0.816e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 RABAC1-202ENST00000595226 725 ntTSL 219.65■□□□□ 0.746e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 RABAC1-206ENST00000600292 653 ntTSL 219.48■□□□□ 0.716e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 RABAC1-207ENST00000601028 530 ntTSL 216.9■□□□□ 0.36e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 PHF1-209ENST00000487667 1930 ntTSL 521.98■■□□□ 1.113e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.364e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 GRK2-202ENST00000416281 4493 ntTSL 214.38□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-8■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-8■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-8■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-8■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 IDUA-212ENST00000514698 2185 ntTSL 520.25■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-6■■■■□ 22.4
PCBP1Q15365 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.017e-15■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.567e-15■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.117e-15■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 SLC7A8-211ENST00000528860 1499 ntTSL 216.6■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.454e-25■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.214e-25■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 526.44■■□□□ 1.822e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 325.91■■□□□ 1.742e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 225.19■■□□□ 1.622e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.462e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.462e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.462e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 320.84■□□□□ 0.932e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 219.92■□□□□ 0.782e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.662e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-46■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 EHBP1L1-211ENST00000634639 1643 ntTSL 527.26■■□□□ 1.954e-11■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 EHBP1L1-208ENST00000533237 2267 ntTSL 526.85■■□□□ 1.894e-11■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.254e-11■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 EHBP1L1-210ENST00000533465 793 ntTSL 321.11■□□□□ 0.974e-11■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 EHBP1L1-202ENST00000526990 3169 nt12.55□□□□□ -0.44e-11■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.111e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 RERE-216ENST00000505225 533 ntTSL 27.73□□□□□ -1.171e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 517.71■□□□□ 0.438e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-9■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 PPP1R15A-202ENST00000600406 1725 nt16.8■□□□□ 0.281e-9■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 SLC19A1-206ENST00000460174 600 ntTSL 315.19■□□□□ 0.028e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.088e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.198e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 ARID1B-201ENST00000319584 2199 ntTSL 213.1□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.328e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 DOT1L-206ENST00000482433 3658 ntTSL 211.92□□□□□ -0.58e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 FST-203ENST00000491717 640 ntTSL 210.85□□□□□ -0.678e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.818e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 59.73□□□□□ -0.858e-8■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.47□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 ARID1B-206ENST00000452544 4443 ntTSL 27.58□□□□□ -1.21e-6■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.692e-9■■■■□ 22.3
PCBP1Q15365 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 22.2
PCBP1Q15365 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 22.2
PCBP1Q15365 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.324e-8■■■■□ 22.2
PCBP1Q15365 FCGRT-218ENST00000600273 582 ntTSL 218.84■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 22.2
PCBP1Q15365 FCGRT-216ENST00000599701 579 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-6■■■■□ 22.2
PCBP1Q15365 FCGRT-207ENST00000595677 714 ntTSL 516.32■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 22.2
PCBP1Q15365 FCGRT-213ENST00000598491 578 ntTSL 516.27■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 22.2
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.921e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-210ENST00000595806 1659 ntTSL 222.35■■□□□ 1.171e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.391e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.081e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.071e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 515.33■□□□□ 0.041e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.014e-8■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-8■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.34e-8■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.394e-8■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-217ENST00000495731 461 ntTSL 330.54■■■□□ 2.481e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.411e-6■■■■□ 22.1
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