Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACAP1Q15027 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACAP1Q15027 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms