Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPD2Q15021 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPD2Q15021 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.4 ms