Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD4Q14CM0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMPD4Q14CM0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms