Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1I3Q14994 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1I3Q14994 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms