Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP1Q13835 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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