Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL3Q13618 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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