Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PEX6Q13608 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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