Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAMK2DQ13557 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAMK2DQ13557 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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