Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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