Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IKZF1Q13422 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IKZF1Q13422 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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