Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B2Q13367 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3B2Q13367 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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