Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGCGQ13326 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGCGQ13326 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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