Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATMQ13315 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATMQ13315 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATMQ13315 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATMQ13315 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATMQ13315 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATMQ13315 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATMQ13315 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATMQ13315 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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