Protein–RNA interactions for Protein: Q13162

PRDX4, Peroxiredoxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX4Q13162 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRDX4Q13162 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRDX4Q13162 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms