Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSTF3Q12996 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTF3Q12996 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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