Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSPB3Q12988 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSPB3Q12988 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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