Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TP53BP1Q12888 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TP53BP1Q12888 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms