Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPTFQ12830 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BPTFQ12830 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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