Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 MSM1YGR171C 1728 nt2.25□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 IRE1YHR079C 3348 nt2.24□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 CSF1YLR087C 8877 nt2.24□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 CSH1YBR161W 1131 nt2.24□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 SWA2YDR320C 2007 nt2.24□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YBP1YBR216C 2025 nt2.23□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YBL096CYBL096C 309 nt2.23□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 LDB17YDL146W 1476 nt2.23□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 YJL113WYJL113W 4647 nt2.22□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 TAM41YGR046W 1158 nt2.22□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 MSH5YDL154W 2706 nt2.22□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 CFT2YLR115W 2580 nt2.22□□□□□ -2.05
TY2B-BQ12491 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YBR090CYBR090C 369 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 HDA2YDR295C 2025 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YIL102CYIL102C 306 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 CPR8YNR028W 927 nt2.21□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 PCK1YKR097W 1650 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 ATP17YDR377W 306 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 LSM1YJL124C 519 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 SYC1YOR179C 567 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YPR177CYPR177C 372 nt2.2□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 MCD1YDL003W 1701 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 SCL1YGL011C 759 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YML003WYML003W 873 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 MRPL33YMR286W 261 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 SSN8YNL025C 972 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 POC4YPL144W 447 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 HPA2YPR193C 471 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 VMA9YCL005W-A 222 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 ORC2YBR060C 1863 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 APM1YPL259C 1428 nt2.19□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 NSE1YLR007W 1011 nt2.18□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YNL035CYNL035C 1170 nt2.18□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 LAP3YNL239W 1365 nt2.18□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.18□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 APM3YBR288C 1452 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 UBP3YER151C 2739 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 PHO13YDL236W 939 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 PEX21YGR239C 867 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YNL165WYNL165W 1221 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 SMY2YBR172C 2223 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 ELG1YOR144C 2376 nt2.17□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 CLU1YMR012W 3834 nt2.16□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 SLX9YGR081C 633 nt2.16□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.16□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 OST1YJL002C 1431 nt2.16□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 BUD3YCL014W 4911 nt2.16□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 VPS35YJL154C 2835 nt2.16□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 DSN1YIR010W 1731 nt2.16□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YJL015CYJL015C 285 nt2.15□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 YKR047WYKR047W 306 nt2.15□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 PKR1YMR123W 369 nt2.15□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 PHR1YOR386W 1698 nt2.15□□□□□ -2.06
TY2B-BQ12491 SPO75YLL005C 2607 nt2.15□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 TPM2YIL138C 486 nt2.15□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 UBP8YMR223W 1416 nt2.15□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.14□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 TOP2YNL088W 4287 nt2.14□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 GSH2YOL049W 1476 nt2.14□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 ROM2YLR371W 4071 nt2.14□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 TOP1YOL006C 2310 nt2.14□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 NEL1YHR035W 1893 nt2.13□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 YKU80YMR106C 1890 nt2.13□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 RPS25AYGR027C 327 nt2.13□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 SDP1YIL113W 630 nt2.13□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.13□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 PSY3YLR376C 729 nt2.13□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 MAC1YMR021C 1254 nt2.13□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 NRG2YBR066C 663 nt2.13□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 YCR099CYCR099C 468 nt2.12□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 GLG2YJL137C 1143 nt2.12□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 PAN2YGL094C 3348 nt2.12□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 DUF1YOL087C 3351 nt2.11□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 YPR089WYPR089W 2667 nt2.11□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 RSM25YIL093C 795 nt2.11□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 YKL071WYKL071W 771 nt2.11□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 PIS1YPR113W 663 nt2.1□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 NUP157YER105C 4176 nt2.1□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 NRP1YDL167C 2160 nt2.1□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 YER121WYER121W 345 nt2.1□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 PHO81YGR233C 3537 nt2.1□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 UBX3YDL091C 1368 nt2.09□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 YNL235CYNL235C 432 nt2.09□□□□□ -2.07
TY2B-BQ12491 ART10YLR392C 1557 nt2.09□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 DOP1YDR141C 5097 nt2.08□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 USO1YDL058W 5373 nt2.08□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 MRP10YDL045W-A 288 nt2.08□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 NDL1YLR254C 570 nt2.08□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 RRP14YKL082C 1305 nt2.07□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 RNR4YGR180C 1038 nt2.07□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 OSW5YMR148W 447 nt2.07□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 YLR422WYLR422W 5799 nt2.07□□□□□ -2.08
TY2B-BQ12491 YDL199CYDL199C 2064 nt2.07□□□□□ -2.08
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