Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 FOB1YDR110W 1701 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 NRD1YNL251C 1728 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YGL149WYGL149W 306 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YJL150WYJL150W 303 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 TMA22YJR014W 597 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 PGA1YNL158W 597 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YBR016WYBR016W 387 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 TSC3YBR058C-A 243 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 HSP26YBR072W 645 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 GDT1YBR187W 843 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 RAT1YOR048C 3021 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 SHS1YDL225W 1656 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 TRK2YKR050W 2670 nt4.89□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 TGL3YMR313C 1929 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 GPI8YDR331W 1236 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YGL165CYGL165C 579 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YIL024CYIL024C 570 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 MSL1YIR009W 336 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YKL069WYKL069W 543 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 BUD28YLR062C 378 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YBL083CYBL083C 426 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YOR302WYOR302W 78 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 PIN3YPR154W 648 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YBP1YBR216C 2025 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 SHE10YGL228W 1734 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 RRN3YKL125W 1884 nt4.88□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 SSY5YJL156C 2100 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 VAC8YEL013W 1737 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 THS1YIL078W 2205 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YDR344CYDR344C 444 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 VAM10YOR068C 345 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 GPI10YGL142C 1851 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 SKN7YHR206W 1869 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 SPC97YHR172W 2472 nt4.87□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 IZH3YLR023C 1632 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YJL016WYJL016W 1686 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 MPP10YJR002W 1782 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 SPB4YFL002C 1821 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 VPS27YNR006W 1869 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 THI13YDL244W 1023 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YDR355CYDR355C 303 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 VAM7YGL212W 951 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 THI12YNL332W 1023 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 PRP39YML046W 1890 nt4.86□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 SNT2YGL131C 4212 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 IRC2YDR112W 309 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 CPR5YDR304C 678 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YER088C-AYER088C-A 324 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 PAM18YLR008C 507 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 RPS16AYMR143W 432 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 DPB3YBR278W 606 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 VPS73YGL104C 1461 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 ATG21YPL100W 1491 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 HAP1YLR256W 4509 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 DIE2YGR227W 1578 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 MCD1YDL003W 1701 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 CAB3YKL088W 1716 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 PWP1YLR196W 1731 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 MKT1YNL085W 2493 nt4.85□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 FOL1YNL256W 2475 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 RTS1YOR014W 2274 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 PPZ1YML016C 2079 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 UBA2YDR390C 1911 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 RNH70YGR276C 1662 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 ARG4YHR018C 1392 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 GYP6YJL044C 1377 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 RPL34AYER056C-A 366 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 SLX8YER116C 825 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YIL012WYIL012W 342 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 RPL34BYIL052C 366 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 RPL40AYIL148W 387 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 YNL276CYNL276C 396 nt4.84□□□□□ -1.63
TY1A-BLQ12266 BUD14YAR014C 2130 nt4.84□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 ACS2YLR153C 2052 nt4.84□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 SWP82YFL049W 1872 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 AEP3YPL005W 1821 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 MET7YOR241W 1647 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 RPL30YGL030W 318 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 COX17YLL009C 210 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 HCS1YKL017C 2052 nt4.83□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 WHI3YNL197C 1986 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 LEU1YGL009C 2340 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YDR262WYDR262W 819 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 HMF1YER057C 390 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 GRX4YER174C 735 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YPS5YGL259W 498 nt4.82□□□□□ -1.64
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