Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPAL4Q0D2K0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPAL4Q0D2K0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms