Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM27E3Q08E93 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms