Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms