Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNFRSF17Q02223 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNFRSF17Q02223 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms