Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTUD4Q01804 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD4Q01804 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms