Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42EP1Q00587 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP1Q00587 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms