Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms